（1）生态系统中，绿色植物能够通过光合作用制造有机物．有机物中储存着来自阳光的能量．植物制造的有机物，不仅养活了植物自身，还为动物的生存提供食物，因此，植物是生态系统中的生产者．该生态系统中生物所需能量的根本来源是太阳光；有机物的制造者是藻类．

　　（2）根据分析可知，生态系统中的一条食物链：①藻类→浮游动物→小鱼→大鱼；②藻类→浮游动物→虾→小鱼→大鱼；③藻类→浮游动物→虾→大鱼．

　　（3）在生态系统中，如食物链：藻类→浮游动物→小鱼→大鱼，浮游动物吃藻类，藻类进行光合作用储存的物质和能量就进入了浮游动物的体内，小鱼吃浮游动物，浮游动物体内储存的物质和能量就到了小鱼体内．同样小鱼体内的物质能量优到了大鱼的体内．因此，该生态系统中的物质和能量也是沿着食物链和食物网流动的．

　　（4）生物的多样性包括物种的多样性、基因的多样性和生态系统的多样性，当生态系统发生剧烈变化时会加速生物种类的多样性和基因多样性的丧失，因此保护海洋生物的种类就保护了海洋生态，是保护海洋生物多样性的根本措施．

　　（5）厦门海洋资源丰富，拥有国家一级或二级保护动物，如文昌鱼和岩鹭等．

　　故答案为：（1）太阳光；藻类；

　　（2）藻类→浮游动物→小鱼→大鱼；

　　（3）能量；

　　（4）种类；

　　（5）文昌鱼．