A、由题意分析已知该生态系统存在着两条食物链，而能量流动是沿着食物链、食物网进行的，所以主要体现了该生态系统的物质循环和能量流动功能，同时食物链的各种生物之间存在着信息传递功能，A正确；

　　B、由题意分析已知在稻-鸭-萍共作这种生态农业模式中存在两天食物链：稻→有害昆虫→鸭、红萍→鸭，所以鸭子既是初级消费者，又是次级消费者，B正确；

　　C、生态系统的生物群落包括生产者、消费者和分解者，所以该生物群落除了水稻、红萍和鸭子以外，还应该包括分解者，C错误；

　　D、水生植物红萍（满江红）适于荫蔽环境，其与水稻分层分布，有利于充分利用光能，提高光能利用率，D正确．

　　故选：C．