A、组成细胞的有机分子可能因物种不同而存在差异主要指蛋白质，并不是各种有机分子都因物种不同而存在差异，如：葡萄糖、氨基酸、核苷酸等不同物种中结构相同，动物细胞中的糖原、脂肪等的结构也相同，植物细胞的淀粉、纤维素等的结构也相同，A错误；

　　B、DNA分子的多样性主要由碱基对的排列顺序决定，B错误；

　　C、人体内内发挥信息传递作用的分子不都是蛋白质，如性激素，属于脂质，C错误；

　　D、蛋白质是细胞中含量最高的有机物，D正确．

　　故选：D．