A、器官是由不同的组织按照一定的次序联合在一起构成的一个具有一定功能的结构，一粒菜豆种子的最外面是种皮，属于保护组织，里面的子叶等部分含丰富的营养物质，属于营养组织，可见一粒种子是由不同组织构成的一个器官而不是植物体．故符合题意．

　　B、甲图①②阶段表示种子的萌发，菜豆种子的营养物质储存在子叶里，其需要的能量来自于种子的呼吸作用分解其内的有机物所释放的能量，故不符合题意．

　　C、种子的萌发过程中，构成胚的细胞不断进行生长、分裂、分化，最终胚根发育成根，胚芽发育成茎叶，胚轴发育成连接根和茎的部分，可见，种子萌发的过程，实际上是细胞的生长、分裂和分化的过程，故不符合题意．

　　D、分析乙图可知，随着种植密度的增加，植物光合作用的强度逐渐降低，影响有机物的合成，不利于增产，因此在种植农作物时，我们要注意合理密植，既不能过密，也不能过疏，使植物充分接受阳光，充分进行光合作用，制造有机物，达到增产的目的．故不符合题意．

　　故选A